Sin lugar a dudas la parte fundamental de todo curso de Química Orgánica, es el estudio de los grupos funcionales, ya que estos son el sitio activo de cualquier molécula o sea la parte que le da las características físicas y químicas particulares, esto es tomando en cuenta que el resto de las estructuras moleculares normalmente son parte de hidrocarburos Arílicos alquílicos. Dada la gran variedad de grupos funcionales, no es posible estudiarlos todos en un semestre, por lo que se ha hecho una selección de los grupos más importantes presentados en cinco unidades que son:
 I Alcoholes

 II Éteres y epóxidos

 III Aldehídos y Cetonas

 IV Ácidos carboxílicos y sus derivados

V Aminas

 En todas las unidades el esquema general será presentar en primer término su estructura, nomenclatura, fuentes de obtención, industrial y de laboratorio, propiedades físicas y químicas, y las reacciones más relevantes incluyendo ejemplos y problemas.